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  • Pregunta: Suponga que está trabajando en el Laboratorio Nacional de Microbiología en Winnipeg, Manitoba, la única instalación de nivel 4 de contención de Canadá donde los científicos pueden trabajar de manera segura con COVID-19 (SARS-CoV-2). En esta etapa, puede realizar sus experimentos en células epiteliales bronquiales humanas normales (NHBE) y modelos de ratón.

    Suponga que está trabajando en el Laboratorio Nacional de Microbiología en Winnipeg, Manitoba, la única instalación de nivel 4 de contención de Canadá donde los científicos pueden trabajar de manera segura con COVID-19 (SARS-CoV-2). En esta etapa, puede realizar sus experimentos en células epiteliales bronquiales humanas normales (NHBE) y modelos de ratón.

    3a) Para combatir el COVID-19, ¿puede diseñar una estrategia CRISPR/Cas apuntando al SARS-CoV-2 en las células NHBE? (El número de acceso al banco de germoplasma para la secuencia del genoma del SARS-CoV-2 es NC_045512)

    3b) Ahora se sabe que la proteína espiga del SARS-CoV-2 se une a la enzima convertidora de angiotensina 2 del receptor del huésped (ACE2), lo que permite que el coronavirus ingrese a las células humanas y se replique. Para combatir el COVID-19, un enfoque es eliminar la proteína ACE2 humana, otro es mejorar la expresión de ACE2 en las células NHBE. ¿Puede elegir UN enfoque (NO ambos) y describir cómo lo haría? (GenBank del gen ACE2 humano: AB046569).
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    3c) Es discutible si usar hidroxicloroquina (HCQ) para tratar pacientes con COVID-19. Para aclararlo, ¿podría diseñar un experimento de una sola célula para determinar los perfiles de transcriptoma de ratones, que están infectados con SARS-CoV-2 y tratados con o sin HCQ? (Nota: los ratones (B6.Cg-Tg(K18-ACE2)2Prlmn/J) que expresan ACE2 humana son del Laboratorio Jackson; las células T CD4+, las células T CD8+, las células B y las células NK podrían ser el foco).

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    Esta es la mejor manera de resolver el problema.
    Solución

    3a) CRISPR-Cas9 es una herramienta de edición del genoma que se puede usar de manera efectiva contra el SARS-CoV-2 dirigiendo el ARN guía en el sistema CRISPR-Cas9 contra genes esenciales del virus, como los genes que codifican la proteína espiga o l

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