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  • Pregunta: Se le da el siguiente resultado de secuenciación: >Secuencia 1 GCATTCTGAGGCATTCTCTAACAGGTTCTCGACCCTCCGCCATGGCCCCGTGGATGCATCTCCTCACCGT GCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGGACCCAACTCTGTTCAGGCCTATTCCAGCCAGCACCTGTGCGGCTCC AACCTAGTGGAGGCACTGTACATGACATGTGGACGGAGTGGCTTTCTATAGACCCCACGACCGCCGAGAGC TGGAGGACCTCCAGGTGGAGCAGGCAGAACTGGGTCTGGAGGCAGGCGGCCTGCAGCCTTCGGCCCTGGA

    Se le da el siguiente resultado de secuenciación:

    >Secuencia 1
    GCATTCTGAGGCATTCTCTAACAGGTTCTCGACCCTCCGCCATGGCCCCGTGGATGCATCTCCTCACCGT

    GCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGGACCCAACTCTGTTCAGGCCTATTCCAGCCAGCACCTGTGCGGCTCC

    AACCTAGTGGAGGCACTGTACATGACATGTGGACGGAGTGGCTTTCTATAGACCCCACGACCGCCGAGAGC

    TGGAGGACCTCCAGGTGGAGCAGGCAGAACTGGGTCTGGAGGCAGGCGGCCTGCAGCCTTCGGCCCTGGA

    GATGATTCTGCAGAAGCGCGGCATTGTGGATCAGTGCTGTAATAACATTTGCACATTTAACCAGCTGCAG

    AACTACTGCAATGTCCCTTAGACACCTGCCTTGGGCCTGGCCTGCTGCTCTGCCCTGGCAACCAATAAAC

    CCCTTGAATGAG

    Tarea:

    Debe ir al sitio web de BLAST y buscar la respuesta a las siguientes preguntas:

    [Atención: al realizar BLAST, use todas las configuraciones predeterminadas como en el sitio web, EXCEPTO para la "Selección de programa", elija optimizar para "Secuencias algo similares (blastn)"]

    a)

    ¿Cuánto dura la secuencia que usó para buscar en la base de datos?

    b)

    ¿Cuál es la identidad más probable de esta secuencia? ¿Qué datos respaldan esta conclusión?

    C)

    ¿Qué organismo es la fuente de la secuencia? ¿Cuál es el nombre común de este organismo?

    d)

    ¿Qué filo contiene este organismo?

    mi)

    ¿Cuál es el número de acceso para esta secuencia?

    F)

    ¿Se expresa esta secuencia? ¿Cómo lo sabes?

    gramo)

    Si se expresa su secuencia, ¿dónde (tejido) se expresa?

    h)

    ¿Se sabe algo sobre los factores que hacen que se exprese su secuencia?

    i)

    ¿Cuántas secuencias puedes encontrar con un valor E menor o igual a 1 X 10 -60 ?

    j)

    Mire la primera secuencia coincidente, ¿cuál es la extensión de la alineación y qué fracción de los nucleótidos coinciden?

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    Esta es la mejor manera de resolver el problema.
    Solución

    Las respuestas correctas son las siguientes: a) La longitud de la secuencia es de 432 nucleótidos. b) La identidad más probable de la secuencia dada es ARNm de insulina Octodon degus, cds completa. Los datos de apoyo son el valor E y el porcentaje de…

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