Pregunta: Estás en una selva tropical de América del Sur buscando péptidos naturales con potencial como fármacos. Tiene un laboratorio de bioquímica móvil con reactivos y enzimas comunes, un analizador de aminoácidos, filtración en gel y cromatografía de intercambio iónico, y electroforesis. También tiene un secuenciador Edman, pero ha contaminado uno o más de sus

Estás en una selva tropical de América del Sur buscando péptidos naturales con potencial como fármacos. Tiene un laboratorio de bioquímica móvil con reactivos y enzimas comunes, un analizador de aminoácidos, filtración en gel y cromatografía de intercambio iónico, y electroforesis. También tiene un secuenciador Edman, pero ha contaminado uno o más de sus reactivos y, como resultado, no puede secuenciar péptidos de más de 12 residuos antes de que los contaminantes oscurezcan los resultados. Mientras analiza extractos de los ovarios de una orquídea tropical, encuentra un péptido con potencial antiviral. Deducir su secuencia de aminoácidos utilizando las herramientas disponibles.

1) MW por electroforesis puede decirle qué tan grande es el problema de secuenciación al que se enfrenta. Resultado: alrededor de 4000

2) El análisis de aminoácidos puede ayudarlo a decidir cómo fragmentar el péptido para la secuenciación: Resultado: A2C2D2E4FG3HKLMN2P2Q2R4S4T3W

3) ¿Cuántos péptidos se esperan de cada uno de estos posibles reactivos de escisión? • Bromuro de cianógeno (lado C de M). • Estafilococo. aureus V8 proteasa (lado C de D y E). • Tripsina (lado C de K y R).

4) La escisión por tripsina seguida de cromatografía de filtración en gel da los 6 productos esperados, que usted secuencia (mostrados en orden de salida de la columna): T-1 ETMESSAGEFGR T-2 SQTWALDHSECR T-3 GPQDNK T-4 TCR T-5 NP T-6R

5) Escisión por Staph. aureus V8 seguida de cromatografía de filtración en gel da los 7 productos esperados, que usted secuencia (mostrados en orden de aparición de la columna): S-1 RSQTWALD S-2 FGRGPQD S-3 NKTCRNP S-4 SSAGE S-5 TME S- 6 CRE S-7 HSE

1. Para ambos conjuntos de péptidos, prediga el orden de elución de una columna de cromatografía de interacción hidrofóbica, dado que los aminoácidos hidrofóbicos son V, L, I, F, A y M.